浜田 道昭 教授

Prof. Michiaki Hamada

2000年3月東北大学理学部数学科卒業,2002年3月 東北大学大学院理学研究科数学専攻修士課程を修了(専門は作用素論; 修士論文).2002年4月より8年半の間,株式会社富士総合研究所(現在のみずほ情報総研株式会社)の研究員として,主に科学技術関連の情報システムの開発に携わる.当該会社在籍中に,NEDO「機能性RNAプロジェクト」に参画し,「バイオインフォマティクス」と初めて出会う.また,同プロジェクトにて,CentroidFoldに代表される数多くのRNA配列情報解析技術の開発を行う.2009年3月東京工業大学大学院総合理工学研究科知能システム科学専攻にて博士(理学)を取得.2010年10月1日より東京大学大学院 新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 特任准教授を経て,2014年4月1日より早稲田大学 理工学術院 准教授(2018年4月より教授)としてバイオインフォマティクス研究室を主宰する.2016年10月1日より産業技術総合研究所招聘研究員(産総研・早大生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ班長),および,2017年4月1日より日本医科大学大学院医学研究科客員教授を兼任する.また,2015年4月1日〜2017年3月31日間に日本バイオインフォマティクス学会理事を拝命する(2020年4月より幹事).1998年に川合数学奨励賞, 1999年3月に青葉理学振興会奨励賞,2008年12月にOxford Journals JSBi Prize, 2010年3月に2008-2009 SIGBIO Best Paper Award,2017年に文部科学大臣表彰の若手科学者賞をそれぞれ受賞.またこれまでに,科研費若手A(2件),挑戦的萌芽研究,挑戦的研究(萌芽),新学術領域(公募研究),戦略的創造研究推進事業(CREST),基盤研究Aの研究代表者を務める.現在の専門はバイオインフォマティクス全般(特に、機能性RNA,エピジェネティクス,次世代シーケンサーに関わる情報技術の開発、バイオインフォマティクスにおけるPPDMの応用,人工知能を用いたRNAアプタマー創薬等)である.今後長く利用されるキラーツールを作り上げ,ソフトウェア・情報技術の側面から生物分野にブレイクスルーを起こすことを目指している.

Dr. Michiaki Hamada was born in 1977. He graduated from the mathematical institute of Tohoku University in Mar 2002. In Apr 2002, he joined to Fuji Research Institute corporation (FRIC), whose current name is Mizuho Information & Research Institute, Inc (MHRI), as a researcher, and conducted system development targeting for science technology. While he was a researcher in FRIC, he started to do research on RNA bioinformatics under a support of “Functional RNA project” funded by NEDO. He received his Ph.D. from Tokyo Institute of technology in Mar 2009. Currently, he is a professor of Faculty of Science and Engineering at Waseda University and is the principal investigator of Bioinformatics Laboratory. He is also a unit leader of Sequence Analysis Algorithm Research unit, Computational Bio Big-Data Open Innovation Laboratory (CBBD-OIL), and an invited researcher of Artificial intelligence Research Center (AIRC) at AIST in Japan. Moreover, he is an invited professor at Nippon Medical University since Apr 2017. He has been a board member of Japanese Society of Bioinformatics (JSBi) since 2014. He received "The Commendation for Science and Technology by the Minister of Education, Culture, Sports, Science, and Technology: The Young Scientists’ Prize" at 2017. His interests include RNA informatics, sequence analysis, epigenetics, data-mining and machine learning. He aims to develop killer tools in the analyses of biological data.

所属 / Affiliation

早稲田大学 / Waseda University

  • 理工学術院 教授(main position)/ Professor, Faculty of Science and Engineering

    • 先進理工学部 電気・情報生命工学科 バイオインフォマティクス研究室 主宰 / Principle Investigator, Bioinformatics Laboratory, Department of Electrical Engineering and Bioscience, Undergraduate School of Advanced Science and Engineering

    • 先進理工学研究科 電気・情報生命専攻 バイオインフォマティクス研究室 主宰 / Principle Investigator, Bioinformatics Laboratory, Department of Electrical Engineering and Bioscience, Graduate School of Advanced Science and Engineering

  • データ科学総合研究教育センター 兼任センター員 / Researcher, Center for Data Science

  • 構造生物・創薬研究所 所員 / Researcher, Institute for Medical-oriented Structural Biology

  • ヒューマンパフォーマンス研究所 所員

産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ(CBBD-OIL)/ AIST-Waseda University Computational Bio Big-Data Open Innovation Laboratory (CBBD-OIL)

  • 配列解析アルゴリズム班 班長 / Team Leader, Sequence analysis algorithm team

産業技術総合研究所 / National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST)

  • 人工知能研究センター(AIRC) 客員研究員 / Visiting Researcher, Artificial Intelligence Research Center (AIRC)

日本医科大学 / Nippon Medical University

  • 大学院医学研究科 客員教授 / Visiting Professor, Graduate School of Medicine

住所 / Address:

早稲田大学 理工学術院 (先進理工学部 電気・情報生命工学科 バイオインフォマティクス研究室)/ Hamada Laboratory (Bioinformatics Laboratory), Faculty of Science and Engineering, Department of Electrical Engineering and Bioscience

〒169-8555 新宿区大久保3-4-1 55号館N棟6階 610B室 [⇒アクセス] / 55N-06-10, 3-4-1, Okubo Shinjuku-ku, Tokyo 169-8555, Japan [>Access]

E-mail: mhamada@waseda.jp / michiaki.hamada@hamadalab.com / michiaki.hamada@gmail.com

学歴 / Education:

  • 1984年4月(昭和59年4月)~1990年3月(昭和60年3月) 東京都東村山市立南台小学校

  • 1990年4月(平成2年4月)~1993年3月(平成5年3月) 千葉県柏市立中原中学校

  • 1993年4月(平成5年4月)~1996年3月(平成8年3月) 千葉県立東葛飾高等学校

  • 1996年4月(平成8年4月)~2000年3月(平成12年3月) 東北大学理学部数学科 / Apr. 1996~Mar. 2000 Department of Mathematics, Tohoku University

  • 2000年4月(平成12年4月)~2002年3月(平成14年3月) 東北大学理学研究科数学専攻修士課程 / Apr. 2000~Mar. 2002 Master course, Mathematical Institute, Tohoku University

  • 2005年10月(平成17年10月)~2009年3月(平成21年3月) 東京工業大学総合理工学研究科知能システム科学専攻博士後期課程 (社会人博士) / Oct. 2005~Mar. 2009. Ph.D. course, Department of Computational Intelligence and System Science, Tokyo Institute of Technology

学位 / Degrees:

  • 2002年3月 修士(理学)(東北大学)/ Mar. 2002 M.S. (Tohoku University)

  • 2009年3月26日 博士(理学)(東京工業大学)/ Mar. 2009. Ph.D. (Tokyo Institute of technology)

職歴 / Job experiences:

  • 2002年4月(平成14年4月)~2004年9月 (平成16年9月)株式会社富士総合研究所(現:みずほ情報総研株式会社) 研究員 / Apr. 2002 - Sep. 2004 Researcher, Fuji Research Institute Corporation, Inc.

  • 2004年10月(平成16年10月)~2006年7月 (平成18年7月)(社名変更により) みずほ情報総研株式会社 研究員 / Oct. 2004 - Jul. 2006. Researcher, Mizuho Information & Research Institute, Inc.

  • 2006年7月(平成18年7月)~2010年9月(平成22年9月) みずほ情報総研株式会社 コンサルタント【富士総研から通算8年半】

  • 2010年10月(平成22年10月)~2014年3月 (平成26年3月)東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻 特任准教授 【3年半】/ Oct. 2010 - Mar. 2014. Associate Professor (non-tenured), Department of computational biology, Graduate School of Frontier Science, The University of Tokyo

  • 2014年4月(平成26年4月)~2018年4月(平成30年4月) 早稲田大学 理工学術院 先進理工学研究科 電気・情報生命専攻 准教授 / Apr. 2014 - Mar. 2018. Associate professor (tenured), Department of Electrical Engineering and Bioscience, Faculty of Science and Engineering, Waseda University

  • 2016年10月(平成28年10月)〜現在 産業技術総合研究所 招聘研究員 (産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ (CBBD-OIL)班長)

  • 2017年4月(平成29年4月)〜現在 日本医科大学 大学院 医学研究科 客員教授 / Apr. 2017-current. Visiting Professor, Graduate School of Medicine, Nippon Medical University

  • 2018年4月(平成30年4月)〜2020年3月 岡山大学 大学院医歯薬学総合研究科 非常勤講師

  • 2018年4月(平成30年4月)~現在 早稲田大学 理工学術院 先進理工学研究科 電気・情報生命専攻 教授 / Apr. 2018 - current. Professor (tenured), Department of Electrical Engineering and Bioscience, Faculty of Science and Engineering, Waseda University

賞罰 / Awards:

  • 1998年: 川合数学奨励賞

  • 1999年3月: 青葉理学振興会奨励賞

  • 2008年12月: Oxford Journals JSBi Prize

  • 2010年3月: 2008-2009 SIGBIO Best Paper Award

  • 2011年8月: The 5th AYRCOB Best Poster Award

  • 2012年10月: BIWO2012 Best Poster Award

  • 2014年12月:GIW-ISCB-Asia 2014 Best Poster Award

  • 2016年4月:産業技術総合研究所 理事長賞(研究)

  • 2017年4月:平成29年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞

公的研究費:

研究代表者(PI)

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(A)、研究代表者、「リピート要素のde novo発見に基づく長鎖ノンコーディングRNAの機能の解明」,2012-04-01 – 2023-03-31

  • 国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業(CREST)「イノベーション創発に資する人工知能基盤技術の創出と統合化」領域, 研究代表者,「人工知能技術を用いた革新的アプタマー創薬システムの開発」 ,平成30年10月〜平成33年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 挑戦的研究 (萌芽), 研究代表者, 「RNA-クロマチン相互作用予 測と応用」, 研究課題番号:17K20032, 平成 29 年 7 月~平成 32 年 3 月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 若手研究(A), 研究代表者, 「機能エレメントと深層学習に基づく長鎖ノンコーディングRNAの機能分類」, 研究課題番号:16H05879, 平成28年4月~平成32年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 新学術領域研究 (公募研究)(研究領域提案型 動的クロマチン構造と機能), 研究代表者, 「ヒストンバリアントに基づくクロマチンの機能の推定」, 研究課題番号:16H01318, 平成28年4月~平成30年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究、研究代表者、「プライバシー保護バイオインフォマティクス基盤技術の開発と応用」、課題番号:25540131、平成25年4月~平成28年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 若手研究(A), 研究代表者, 「修飾・編集RNAの構造予測手法の研究開発」, 研究課題番号:24680031, 平成24年4月~平成27年3月

分担研究者 (co-PI)

  • 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型),分担研究者,『学術研究支援基盤形成』先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(A)、分担研究者、発達期ダイオキシンと老年期の高次認知機能低下の関係性解明,2019-04-01 – 2022-03-31

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(B),分担研究者、ceRNAネットワーク構造の解読を基盤とした、全く新しい抗がん剤開発戦略の開発,2018-07-18 – 2021-03-31

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(A)、分担研究者、「エピトランスクリプトーム解析のためのRNAインフォマティクス基盤技術」、課題番号:、平成28年4月~平成31年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(A)、分担研究者、「RNA・タンパク質相互作用の網羅的予測と検証」、課題番号:25240044、平成25年4月~平成28年3月

連携研究者

  • 科学研究費助成事業 新学術領域研究, lncRNA-mRNAの相互作用ネットワークに基づくlncRNAの機能推定,連携研究者

  • 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム,連携研究者

  • 科学研究費新学術領域研究『生命科学系3分野支援活動』ゲノム支援,連携研究者

  • 戦略的国際科学技術協力推進事業,個別化医療を実現するプライバシー保護ゲノム情報解析,連携研究者

研究業績 / Research achievements:

こちらをご覧ください / See here

所属学会 / Affiliated societies:

  • 日本バイオインフォマティクス学会(JSBi) / The Japanese Society for Bioinformatics

  • 日本RNA学会 / The RNA Society of Japan

  • 日本分子生物学会 / The Molecular Biology Society of Japan (MBSJ)

  • 情報処理学会 / Information Processing Society of Japan (IPSJ)

  • 日本癌学会 / Japanese Cancer Association (JCA)

  • 国際計算生物学会 / International Society of Computational Biology (ISCB)