浜田 道昭 教授

Prof. Michiaki Hamada

2000年3月東北大学理学部数学科卒業,2002年3月 東北大学大学院理学研究科数学専攻修士課程を修了した.専門は関数解析の一分野である作用素論(指導教員:吉野崇教授).2002年4月より8年半の間,株式会社富士総合研究所(現在のみずほリサーチ&テクノロジーズ株式会社)の研究員として,主に科学技術に関連した受託研究開発に携わる.当該会社在籍中に,NEDO「機能性RNAプロジェクト」に参画し,「バイオインフォマティクス」と初めて出会う.同プロジェクトにて,CentroidFoldなどの多くのRNA配列情報解析技術の開発を行う.2009年3月東京工業大学大学院総合理工学研究科知能システム科学専攻にて博士(理学)を取得(指導教員:渡辺澄夫教授).2010年10月1日より東京大学大学院 新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 特任准教授を経て,2014年4月1日より早稲田大学 理工学術院 准教授(2018年4月より教授)としてバイオインフォマティクス研究室を主宰する.2016年10月1日より産業技術総合研究所招聘研究員(産総研・早大生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ班長),および,2017年4月1日より日本医科大学大学院医学研究科客員教授を兼任する.また,2015年4月1日〜2017年3月および2022年4月から現在の間に日本バイオインフォマティクス学会の理事となる(2020年4月より幹事).1998年に川合数学奨励賞, 1999年3月に青葉理学振興会奨励賞,2008年12月にOxford Journals JSBi Prize, 2010年3月に2008-2009 SIGBIO Best Paper Award,2017年に文部科学大臣表彰の若手科学者賞をそれぞれ受賞.またこれまでに,科研費若手A(2件),挑戦的萌芽研究,挑戦的研究(萌芽),新学術領域(公募研究),戦略的創造研究推進事業(CREST),基盤研究Aの研究代表者を務める.現在の専門はバイオインフォマティクス全般(特に,機能性RNA,エピジェネティクス,リピート要素の生物学的機能,核酸医薬開発)である.今後長く利用されるキラーツールを作り上げ,ソフトウェア・情報技術の側面から生物分野にブレイクスルーを起こすことを目指している.

He received his B.S. in Mathematics from Tohoku University in March 2000 and his M.S. in Mathematics from Tohoku University in March 2002, specializing in operator theory, a branch of functional analysis (advisor: Prof. Takashi Yoshino). Afterwards, he worked as a researcher at Fuji Research Institute, where he participated in the NEDO "Functional RNA Project" and was introduced to bioinformatics. In March 2009, he earned his D. from the Department of Intelligent Systems Science at the Graduate School of Interdisciplinary Graduate School of Science and Engineering at Tokyo Institute of Technology, under the supervision of Professor Sumio Watanabe. Since October 2010, he has been an Associate Professor at the Graduate School of Frontier Sciences at The University of Tokyo, and since April 2014, an Associate Professor at the School of Science and Engineering at Waseda University (becoming a Professor in April 2018). He leads the Bioinformatics Laboratory at Waseda University, and is also the Head of the Open Innovation Laboratory at AIST and Waseda University. Since April 2017, he has been a Visiting Professor at the Graduate School of Medicine at Nippon Medical School. He has served as a board member of the Japanese Society for Bioinformatics from April 2015 to March 2017 and from April 2022 to the present. He has received the Kawai Mathematics Encouragement Prize in 1998, the Aoba Society for the Promotion of Science Encouragement Prize in March 1999, the Oxford Journals JSBi Prize in December 2008, the 2008-2009 SIGBIO Best Paper Award in March 2010, and the Young Scientists' Prize of the Commendation for Science and Technology by the Minister of Education, Culture, Sports, Science and Technology in 2017. He has been a principal investigator for many Grant-in-Aid for Scientific Research projects and Core Research for Evolutional Science and Technology (CREST). He is also a member of the Board of Directors of the Japan Society for the Promotion of Science (JSPS). His current research interests include various areas of bioinformatics, particularly functional RNA, epigenetics, biological functions of repeat elements, and nucleic acid drug development. His goal is to develop long-lasting, effective tools and make significant contributions to biology through software and information technology.

所属 / Affiliation

早稲田大学 / Waseda University

  • 理工学術院 教授(main position)/ Professor, Faculty of Science and Engineering

    • 先進理工学部 電気・情報生命工学科 バイオインフォマティクス研究室 主宰 / Principle Investigator, Bioinformatics Laboratory, Department of Electrical Engineering and Bioscience, Undergraduate School of Advanced Science and Engineering

    • 先進理工学研究科 電気・情報生命専攻 バイオインフォマティクス研究室 主宰 / Principle Investigator, Bioinformatics Laboratory, Department of Electrical Engineering and Bioscience, Graduate School of Advanced Science and Engineering

  • データ科学総合研究教育センター 兼任センター員 / Researcher, Center for Data Science

  • 構造生物・創薬研究所 所員 / Researcher, Institute for Medical-oriented Structural Biology

  • ヒューマンパフォーマンス研究所 所員

産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ(CBBD-OIL)/ AIST-Waseda University Computational Bio Big-Data Open Innovation Laboratory (CBBD-OIL)

  • 配列解析アルゴリズム班 班長 / Team Leader, Sequence analysis algorithm team

日本医科大学 / Nippon Medical University

  • 大学院医学研究科 客員教授 / Visiting Professor, Graduate School of Medicine

住所 / Address:

早稲田大学 理工学術院 (先進理工学部 電気・情報生命工学科 バイオインフォマティクス研究室)/ Hamada Laboratory (Bioinformatics Laboratory), Faculty of Science and Engineering, Department of Electrical Engineering and Bioscience

〒169-8555 新宿区大久保3-4-1 55号館N棟6階 610B室 [⇒アクセス] / 55N-06-10, 3-4-1, Okubo Shinjuku-ku, Tokyo 169-8555, Japan [>Access]

E-mail: mhamada@waseda.jp / michiaki.hamada@hamadalab.com / michiaki.hamada@gmail.com

学歴 / Education:

  • 1984年4月(昭和59年4月)~1990年3月(昭和60年3月) 東京都東村山市立南台小学校

  • 1990年4月(平成2年4月)~1993年3月(平成5年3月) 千葉県柏市立中原中学校

  • 1993年4月(平成5年4月)~1996年3月(平成8年3月) 千葉県立東葛飾高等学校

  • 1996年4月(平成8年4月)~2000年3月(平成12年3月) 東北大学理学部数学科 / Apr. 1996~Mar. 2000 Department of Mathematics, Tohoku University

  • 2000年4月(平成12年4月)~2002年3月(平成14年3月) 東北大学理学研究科数学専攻修士課程 / Apr. 2000~Mar. 2002 Master course, Mathematical Institute, Tohoku University

  • 2005年10月(平成17年10月)~2009年3月(平成21年3月) 東京工業大学総合理工学研究科知能システム科学専攻博士後期課程 (社会人博士) / Oct. 2005~Mar. 2009. Ph.D. course, Department of Computational Intelligence and System Science, Tokyo Institute of Technology

学位 / Degrees:

  • 2002年3月 修士(理学)(東北大学)/ Mar. 2002 M.S. (Tohoku University)

  • 2009年3月26日 博士(理学)(東京工業大学)/ Mar. 2009. Ph.D. (Tokyo Institute of technology)

職歴 / Job experiences:

  • 2002年4月(平成14年4月)~2004年9月 (平成16年9月)株式会社富士総合研究所(現:みずほ情報総研株式会社) 研究員 / Apr. 2002 - Sep. 2004 Researcher, Fuji Research Institute Corporation, Inc.

  • 2004年10月(平成16年10月)~2006年7月 (平成18年7月)(社名変更により) みずほ情報総研株式会社 研究員 / Oct. 2004 - Jul. 2006. Researcher, Mizuho Information & Research Institute, Inc.

  • 2006年7月(平成18年7月)~2010年9月(平成22年9月) みずほ情報総研株式会社 コンサルタント【富士総研から通算8年半】

  • 2010年10月(平成22年10月)~2014年3月 (平成26年3月)東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻 特任准教授 【3年半】/ Oct. 2010 - Mar. 2014. Associate Professor (non-tenured), Department of computational biology, Graduate School of Frontier Science, The University of Tokyo

  • 2014年4月(平成26年4月)~2018年4月(平成30年4月) 早稲田大学 理工学術院 先進理工学研究科 電気・情報生命専攻 准教授 / Apr. 2014 - Mar. 2018. Associate professor (tenured), Department of Electrical Engineering and Bioscience, Faculty of Science and Engineering, Waseda University

  • 2016年10月(平成28年10月)〜現在 産業技術総合研究所 招聘研究員 (産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ (CBBD-OIL)班長)

  • 2017年4月(平成29年4月)〜現在 日本医科大学 大学院 医学研究科 客員教授 / Apr. 2017-current. Visiting Professor, Graduate School of Medicine, Nippon Medical University

  • 2018年4月(平成30年4月)〜2020年3月 岡山大学 大学院医歯薬学総合研究科 非常勤講師

  • 2018年4月(平成30年4月)~現在 早稲田大学 理工学術院 先進理工学研究科 電気・情報生命専攻 教授 / Apr. 2018 - current. Professor (tenured), Department of Electrical Engineering and Bioscience, Faculty of Science and Engineering, Waseda University

賞罰 / Awards:

  • 1998年: 川合数学奨励賞

  • 1999年3月: 青葉理学振興会奨励賞

  • 2008年12月: Oxford Journals JSBi Prize

  • 2010年3月: 2008-2009 SIGBIO Best Paper Award

  • 2011年8月: The 5th AYRCOB Best Poster Award

  • 2012年10月: BIWO2012 Best Poster Award

  • 2014年12月:GIW-ISCB-Asia 2014 Best Poster Award

  • 2016年4月:産業技術総合研究所 理事長賞(研究)

  • 2017年4月:平成29年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞

  • 2021年12月 :早稲田大学リサーチアワード(国際研究発信力)

公的研究費:

研究代表者(PI)

  • 国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業(CREST)「イノベーション創発に資する人工知能基盤技術の創出と統合化」領域, 研究代表者,「AIアプタマー創薬プロジェクト」 ,令和2年4月〜令和5年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(A)、研究代表者、「リピート要素のde novo発見に基づく長鎖ノンコーディングRNAの機能の解明」,2020-04-01 – 2023-03-31

  • 国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業(CREST)「イノベーション創発に資する人工知能基盤技術の創出と統合化」領域, 研究代表者,「人工知能技術を用いた革新的アプタマー創薬システムの開発」 ,平成30年10月〜令和2年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 挑戦的研究 (萌芽), 研究代表者, 「RNA-クロマチン相互作用予 測と応用」, 研究課題番号:17K20032, 平成 29 年 7 月~令和1 年 3 月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 若手研究(A), 研究代表者, 「機能エレメントと深層学習に基づく長鎖ノンコーディングRNAの機能分類」, 研究課題番号:16H05879, 平成28年4月~平成32年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 新学術領域研究 (公募研究)(研究領域提案型 動的クロマチン構造と機能), 研究代表者, 「ヒストンバリアントに基づくクロマチンの機能の推定」, 研究課題番号:16H01318, 平成28年4月~平成30年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究、研究代表者、「プライバシー保護バイオインフォマティクス基盤技術の開発と応用」、課題番号:25540131、平成25年4月~平成28年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 若手研究(A), 研究代表者, 「修飾・編集RNAの構造予測手法の研究開発」, 研究課題番号:24680031, 平成24年4月~平成27年3月

分担研究者 (co-PI)

  • 日本医療研究開発機構(AMED),次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業(RNA標的創薬技術開発),分担研究者,機能解析に基づくRNA標的創薬のための統合DBとAIシステムの構築(代表:中谷和彦)

  • 日本医療研究開発機構(AMED),革新的先端研究開発支援事業インキュベートタイプ(LEAP),分担研究者,化学を基盤としたmRNAの分子設計・製造法の革新とワクチンへの展開(代表:阿部洋)

  • 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型),分担研究者,『学術研究支援基盤形成』先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(A)、分担研究者、発達期ダイオキシンと老年期の高次認知機能低下の関係性解明,2019-04-01 – 2022-03-31

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(B),分担研究者、ceRNAネットワーク構造の解読を基盤とした、全く新しい抗がん剤開発戦略の開発,2018-07-18 – 2021-03-31

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(A)、分担研究者、「エピトランスクリプトーム解析のためのRNAインフォマティクス基盤技術」、課題番号:、平成28年4月~平成31年3月

  • 科学研究費助成事業 科学研究費補助金 基盤研究(A)、分担研究者、「RNA・タンパク質相互作用の網羅的予測と検証」、課題番号:25240044、平成25年4月~平成28年3月

連携研究者

  • 科学研究費助成事業 新学術領域研究, lncRNA-mRNAの相互作用ネットワークに基づくlncRNAの機能推定,連携研究者

  • 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム,連携研究者

  • 科学研究費新学術領域研究『生命科学系3分野支援活動』ゲノム支援,連携研究者

  • 戦略的国際科学技術協力推進事業,個別化医療を実現するプライバシー保護ゲノム情報解析,連携研究者

研究業績 / Research achievements:

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所属学会 / Affiliated societies:

  • 日本バイオインフォマティクス学会(JSBi) / The Japanese Society for Bioinformatics

  • 日本RNA学会 / The RNA Society of Japan

  • 日本分子生物学会 / The Molecular Biology Society of Japan (MBSJ)

  • 情報処理学会 / Information Processing Society of Japan (IPSJ)

  • 日本癌学会 / Japanese Cancer Association (JCA)

  • 国際計算生物学会 / International Society of Computational Biology (ISCB)